Добрый день.
Группы (папки) формируются в главном меню в той же последовательности, в которой они встречаются в списке объектов/форм конструктора.
Порядок в списке объектов/форм меняется просто перетаскиванием мышью.
Т.е. если Вам нужно подвинуть наверх определённую группу, то вы перетаскиваете вверх объект/форму, в которой задана такая группа.