Добрый день!
MS Excel с русской локализацией открывает файлы .csv, предполагая, что у них кодировка 1251 (Кириллическая для Windows), в то время как конструктор "База Руна" экспортирует данные в файл с кодировкой 65001 (Юникод UTF-8), не привязываясь к национальным кодировкам.
Если Вам необходимо использовать именно Excel, то тогда надо производить импорт данных из файла .csv.
Откройте Excel, выберите вкладку "Данные" и операцию "Из текстового/CSV-файла" (или "Получить данные"-"Из файла"-"Из текстового/CSV-файла"):

Изначально данные представлены в кириллической кодировке для Windows, которую надо поменять в первом выпадающем списке на "65001: Юникод (UTF-8)":

Операцию закончить командой "Загрузить".
При использовании OpenOffice/LibreOffice Calc или, к примеру, текстового редактора NotePad++, таких сложностей не возникает.
Другой вариант: создать шаблон в форме связи на базе MS Excel и выводить данные при помощи формирования документа. Данная операция требует предварительно созданного шаблона и более длительная при выполнении, но не требует никаких дополнительных действий.